Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSTF1Q05048 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms