Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 YLR462WYLR462W 609 nt5.44□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 HPF1YOL155C 2904 nt5.44□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 PUS9YDL036C 1389 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 THP1YOL072W 1368 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 SBE2YDR351W 2595 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 FMP30YPL103C 1407 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 SCM3YDL139C 672 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 SCL1YGL011C 759 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 NIT2YJL126W 924 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YKR041WYKR041W 753 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 SPC3YLR066W 555 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 ERV41YML067C 1059 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 MFM1YPL060W 1242 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 HSP26YBR072W 645 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YBR089WYBR089W 600 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 KEX1YGL203C 2190 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 RAD16YBR114W 2373 nt5.43□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 FBP26YJL155C 1359 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 IME4YGL192W 1803 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YDR282CYDR282C 1245 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YDR336WYDR336W 945 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 BGL2YGR282C 942 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 MTW1YAL034W-A 870 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 NSE1YLR007W 1011 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 BUD28YLR062C 378 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YNR061CYNR061C 660 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 MPD1YOR288C 957 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 MMT2YPL224C 1455 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 HRK1YOR267C 2280 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 DAK1YML070W 1755 nt5.42□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 ALG11YNL048W 1647 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 PDC1YLR044C 1692 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YCR016WYCR016W 873 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YCR050CYCR050C 309 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YDL026WYDL026W 312 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 PCL2YDL127W 927 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 ERD1YDR414C 1089 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YNG2YHR090C 849 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 KTI12YKL110C 942 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YLR225CYLR225C 1224 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 CDA2YLR308W 939 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YIP3YNL044W 531 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 ATG19YOL082W 1248 nt5.41□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 CTS1YLR286C 1689 nt5.4□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 CDC6YJL194W 1542 nt5.4□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 DCD1YHR144C 939 nt5.4□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YRA2YKL214C 612 nt5.4□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 CTL1YMR180C 963 nt5.4□□□□□ -1.54
CEF1Q03654 YPK3YBR028C 1578 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SAC1YKL212W 1872 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 CMK1YFR014C 1341 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 PRO2YOR323C 1371 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MCM2YBL023C 2607 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 NPL4YBR170C 1743 nt5.4□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YGR266WYGR266W 2106 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 RTG3YBL103C 1461 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 BUD8YLR353W 1812 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 PRR1YKL116C 1557 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SSA2YLL024C 1920 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YGL036WYGL036W 2730 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YFT2YDR319C 825 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 RPB7YDR404C 516 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 CIR1YGR207C 786 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 FMP33YJL161W 543 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 PSY3YLR376C 729 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 RPS1BYML063W 768 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 HLJ1YMR161W 675 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SSY5YJL156C 2100 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 TEL1YBL088C 8364 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 GPB1YOR371C 2694 nt5.39□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 JEM1YJL073W 1938 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MMT1YMR177W 1533 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MRPL32YCR003W 552 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YDL012CYDL012C 324 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 IWR1YDL115C 1062 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 IRC6YFR043C 714 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MPS2YGL075C 1164 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SFH5YJL145W 885 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YKL071WYKL071W 771 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 TFB6YOR352W 1032 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YGR125WYGR125W 3111 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SLT2YHR030C 1455 nt5.38□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MSH1YHR120W 2880 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 BUD30YDL151C 582 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YHR112CYHR112C 1137 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 TTI2YJR136C 1266 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 JLP1YLL057C 1239 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 ORM2YLR350W 651 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 PRE7YBL041W 726 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 DCP1YOL149W 696 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YPL191CYPL191C 1083 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 COT1YOR316C 1320 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 BUD7YOR299W 2241 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 MTC1YJL123C 1437 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 PUS1YPL212C 1635 nt5.37□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 YDL124WYDL124W 939 nt5.36□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SAE3YHR079C-A 276 nt5.36□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 SPL2YHR136C 447 nt5.36□□□□□ -1.55
CEF1Q03654 RPB4YJL140W 666 nt5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24 ms