Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CENPCQ03188 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CENPCQ03188 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CENPCQ03188 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms