Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NHLH1Q02575 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NHLH1Q02575 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NHLH1Q02575 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms