Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SATB1Q01826 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms