Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF2Q01130 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SRSF2Q01130 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF2Q01130 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SRSF2Q01130 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms