Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKOR1P84550 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKOR1P84550 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms