Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMAD3P84022 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD3P84022 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms