Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2D2P62837 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2D2P62837 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms