Protein–RNA interactions for Protein: P57081

WDR4, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase non-catalytic subunit WDR4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4P57081 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR4P57081 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR4P57081 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR4P57081 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR4P57081 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR4P57081 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR4P57081 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR4P57081 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
WDR4P57081 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR4P57081 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR4P57081 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR4P57081 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR4P57081 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms