Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBASH3AP57075 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBASH3AP57075 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms