Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTBP2P56545 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTBP2P56545 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms