Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CRISP3P54108 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CRISP3P54108 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms