Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	OM14	YBR230C	405 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ARC40	YBR234C	1155 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	EKI1	YDR147W	1605 nt		4.57	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	MNN10	YDR245W	1182 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YFR034W-A	YFR034W-A	288 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SUT1	YGL162W	900 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YLF2	YHL014C	1218 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YLR036C	YLR036C	612 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	CDC42	YLR229C	576 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	POP3	YNL282W	588 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RAD17	YOR368W	1206 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YPL077C	YPL077C	723 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	POP4	YBR257W	840 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RRP3	YHR065C	1506 nt		4.56	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	GAS4	YOL132W	1416 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TCO89	YPL180W	2400 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TAF5	YBR198C	2397 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	MRPL7	YDR237W	879 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	HNT2	YDR305C	654 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	CAF16	YFL028C	870 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TIM21	YGR033C	720 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YPR015C	YPR015C	744 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YBR196C-B	YBR196C-B	105 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YPK9	YOR291W	4419 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TIP20	YGL145W	2106 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	HRR25	YPL204W	1485 nt		4.55	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	SUP35	YDR172W	2058 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RMD1	YDL001W	1293 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	RPN12	YFR052W	825 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	GAT4	YIR013C	366 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YJL218W	YJL218W	591 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	REX3	YLR107W	1215 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	POS5	YPL188W	1245 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TOM5	YPR133W-A	153 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YPR174C	YPR174C	666 nt		4.54	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	CYM1	YDR430C	2970 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TEL1	YBL088C	8364 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	TOG1	YER184C	2385 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	THI22	YPR121W	1719 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YDR249C	YDR249C	1122 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ATP5	YDR298C	639 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	NOP16	YER002W	696 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	MLC1	YGL106W	450 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	YGL194C-A	YGL194C-A	243 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ISA1	YLL027W	753 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	NDJ1	YOL104C	1059 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ANT1	YPR128C	987 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	ADP1	YCR011C	3150 nt		4.53	□□□□□ -1.68
DSL1	P53847	UPC2	YDR213W	2742 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	EAR1	YMR171C	1653 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	KNH1	YDL049C	807 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	AAD10	YJR155W	867 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YNL234W	YNL234W	1281 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	PUT1	YLR142W	1431 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	OPT2	YPR194C	2634 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YER158C	YER158C	1722 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RAD30	YDR419W	1899 nt		4.52	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RRB1	YMR131C	1536 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	ARD1	YHR013C	717 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SER1	YOR184W	1188 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SUI3	YPL237W	858 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	BBP1	YPL255W	1158 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RAD57	YDR004W	1383 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	RAD28	YDR030C	1521 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	GAS2	YLR343W	1668 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	PRD1	YCL057W	2139 nt		4.51	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	COT1	YOR316C	1320 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YDR545C-A	YDR545C-A	480 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YEL077W-A	YEL077W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YER190C-B	YER190C-B	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YFL068W	YFL068W	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YGL101W	YGL101W	648 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YGR296C-B	YGR296C-B	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YHL050W-A	YHL050W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	CIA2	YHR122W	696 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YHR219C-A	YHR219C-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YIL177W-A	YIL177W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YJL225W-A	YJL225W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLL066W-A	YLL066W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLL067W-A	YLL067W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	BUD28	YLR062C	378 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YBL006W-A	YBL006W-A	150 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLR466C-A	YLR466C-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLR467C-A	YLR467C-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YML133W-B	YML133W-B	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YNL339W-B	YNL339W-B	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YBL113W-A	YBL113W-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YOR396C-A	YOR396C-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YPL283W-B	YPL283W-B	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YPR204C-A	YPR204C-A	483 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YJR015W	YJR015W	1533 nt		4.5	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SAS10	YDL153C	1833 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	SPO16	YHR153C	597 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YKR047W	YKR047W	306 nt		4.49	□□□□□ -1.69
DSL1	P53847	YLR374C	YLR374C	390 nt		4.49	□□□□□ -1.69

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