Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KPNA1P52294 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KPNA1P52294 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms