Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NEK4P51957 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NEK4P51957 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NEK4P51957 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEK4P51957 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NEK4P51957 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NEK4P51957 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NEK4P51957 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK4P51957 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK4P51957 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK4P51957 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NEK4P51957 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NEK4P51957 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEK4P51957 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms