Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LUMP51884 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LUMP51884 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LUMP51884 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LUMP51884 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LUMP51884 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LUMP51884 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LUMP51884 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LUMP51884 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LUMP51884 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms