Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN2P49810 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN2P49810 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms