Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSNK1EP49674 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSNK1EP49674 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms