Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIK3CAP42336 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIK3CAP42336 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms