Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX1P40424 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX1P40424 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PBX1P40424 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PBX1P40424 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PBX1P40424 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PBX1P40424 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX1P40424 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX1P40424 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PBX1P40424 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX1P40424 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX1P40424 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX1P40424 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PBX1P40424 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PBX1P40424 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PBX1P40424 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBX1P40424 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms