Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZEB1P37275 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZEB1P37275 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
ZEB1P37275 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZEB1P37275 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms