Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA13P31271 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA13P31271 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms