Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECHS1P30084 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ECHS1P30084 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms