Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNGA1P29973 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CNGA1P29973 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 597.2 ms