Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMOD1P29536 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMOD1P29536 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMOD1P29536 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms