Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCAP28676 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCAP28676 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCAP28676 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCAP28676 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCAP28676 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCAP28676 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCAP28676 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GCAP28676 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GCAP28676 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms