Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLD1P28340 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLD1P28340 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POLD1P28340 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POLD1P28340 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLD1P28340 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLD1P28340 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLD1P28340 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLD1P28340 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD1P28340 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD1P28340 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLD1P28340 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD1P28340 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD1P28340 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLD1P28340 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLD1P28340 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD1P28340 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD1P28340 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
POLD1P28340 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD1P28340 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD1P28340 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD1P28340 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD1P28340 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLD1P28340 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLD1P28340 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POLD1P28340 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLD1P28340 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLD1P28340 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLD1P28340 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms