Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTAFRP25105 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTAFRP25105 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms