Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP1P23763 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP1P23763 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms