Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ERBB3P21860 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ERBB3P21860 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ERBB3P21860 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms