Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP4AP20648 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP4AP20648 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms