Protein–RNA interactions for Protein: P17676

CEBPB, CCAAT/enhancer-binding protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPBP17676 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEBPBP17676 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CEBPBP17676 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms