Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CKMT2P17540 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms