Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CREB1P16220 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CREB1P16220 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CREB1P16220 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB1P16220 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB1P16220 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CREB1P16220 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CREB1P16220 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CREB1P16220 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CREB1P16220 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB1P16220 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB1P16220 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB1P16220 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB1P16220 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB1P16220 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB1P16220 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms