Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT10P13645 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT10P13645 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT10P13645 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT10P13645 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT10P13645 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT10P13645 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT10P13645 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT10P13645 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KRT10P13645 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms