Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CHGAP10645 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CHGAP10645 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHGAP10645 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHGAP10645 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHGAP10645 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CHGAP10645 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHGAP10645 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHGAP10645 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHGAP10645 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CHGAP10645 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHGAP10645 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CHGAP10645 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CHGAP10645 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CHGAP10645 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CHGAP10645 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHGAP10645 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHGAP10645 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CHGAP10645 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CHGAP10645 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHGAP10645 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CHGAP10645 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHGAP10645 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHGAP10645 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHGAP10645 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CHGAP10645 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CHGAP10645 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHGAP10645 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHGAP10645 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHGAP10645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHGAP10645 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHGAP10645 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHGAP10645 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHGAP10645 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CHGAP10645 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CHGAP10645 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHGAP10645 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHGAP10645 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHGAP10645 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHGAP10645 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CHGAP10645 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms