Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC175P0C221 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC175P0C221 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms