Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VIL1P09327 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VIL1P09327 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VIL1P09327 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIL1P09327 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIL1P09327 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIL1P09327 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VIL1P09327 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VIL1P09327 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VIL1P09327 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VIL1P09327 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms