Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLBP06746 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLBP06746 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLBP06746 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLBP06746 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLBP06746 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLBP06746 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLBP06746 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLBP06746 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLBP06746 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLBP06746 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLBP06746 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLBP06746 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLBP06746 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLBP06746 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLBP06746 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLBP06746 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.6 ms