Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TYMSP04818 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TYMSP04818 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TYMSP04818 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TYMSP04818 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TYMSP04818 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TYMSP04818 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms