Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRM2P04554 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRM2P04554 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRM2P04554 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PRM2P04554 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PRM2P04554 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PRM2P04554 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PRM2P04554 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms