Protein–RNA interactions for Protein: P03897

MT-ND3, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND3P03897 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MT-ND3P03897 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MT-ND3P03897 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms