Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPTXRO95502 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPTXRO95502 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms