Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZIC2O95409 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZIC2O95409 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZIC2O95409 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZIC2O95409 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZIC2O95409 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZIC2O95409 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZIC2O95409 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms