Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIF4AO95239 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF4AO95239 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF4AO95239 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms