Protein–RNA interactions for Protein: O94782

USP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP1O94782 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP1O94782 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP1O94782 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP1O94782 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP1O94782 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP1O94782 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP1O94782 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP1O94782 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP1O94782 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP1O94782 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP1O94782 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP1O94782 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP1O94782 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP1O94782 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP1O94782 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms