Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM3O75607 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM3O75607 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM3O75607 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM3O75607 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NPM3O75607 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NPM3O75607 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NPM3O75607 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NPM3O75607 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NPM3O75607 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NPM3O75607 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NPM3O75607 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NPM3O75607 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NPM3O75607 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NPM3O75607 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NPM3O75607 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NPM3O75607 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms