Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SEC22BO75396 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SEC22BO75396 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms