Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBNO60934 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBNO60934 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBNO60934 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBNO60934 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBNO60934 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBNO60934 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBNO60934 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBNO60934 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBNO60934 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBNO60934 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBNO60934 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBNO60934 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBNO60934 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBNO60934 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBNO60934 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms